河海大学是实施国家“211工程”重点建设、国家优势学科创新平台建设、一流学科建设以及设立研究生院的高校,国家首批授权授予学士、硕士和博士学位的高校之一。水利工程、环境科学与工程2个学科入围一流学科建设名单。“工程学”、“环境/生态学”、“计算机科学”、“材料科学”、“地球科学”5个学科进入ESI世界排名前1%。在全国第四轮学科评估中，水利工程学科以优异成绩获评A+。土木工程和环境科学与工程2个学科位列A类，跻身全国前10%。马克思主义理论、管理科学与工程、工商管理3个学科获评B+，位列全国前20%。拥有1个一级学科国家重点学科（水利工程），7个二级学科国家重点学科，2个二级学科国家重点学科培育点，15个一级学科省级重点学科；15个博士后流动站。共有43个学位授权点，覆盖了哲学、经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、农学、管理学等9个学科门类。其中16个一级学科博士学位授权点、38个一级学科硕士学位授权点（含一级博士点）、5个二级学科硕士学位授权点、12个硕士专业学位类别授权点，其中工程硕士包括19个工程领域。